Кафедра систем автоматизированного проектирования (САПР) образована в соответствии с приказом Минвуза РСФСР 1 сентября 1984 года на базе кафедры конструирования электронно-вычислительной аппаратуры (КЭВА), на конструкторско-технологическом факультете Томского института автоматизированных систем управления и радиоэлектроники (ТИАСУР).

Кафедре САПР поручено преподавание и профилирование дисциплин специализации 0648.02 "Конструирование и производство технических средств САПР" для двух учебных групп (группы 74-4,5; 73-4,5; 72-4; 71-3,4), а также базовых дисциплин САПР-цикла для специальностей института.

Основатель и первый заведующий кафедрой САПР - доцент, к.т.н. Винтизенко Игорь Георгиевич.
С кафедры КЭВА на кафедру САПР перешли следующие сотрудники:
Киселев Олег Николаевич - доцент, к.т.н.;
Постникова Валентина Яковлевна - ст. преподаватель;
Малых Игорь Георгиевич - ассистент;
Неяскин Степан Александрович - ассистент;
Герасим Геннадий Антонович - ассистент;
Мирных Юрий Федорович - ассистент;
Аблязов Евгений Александрович - ассистент;
Семисошенко Виктор Николаевич - ассистент;
Лесных Юрий Иванович - начальник ЭВМ;
Лесных Галина Андреевна - инженер;
Прянишников Александр Гаврилович - начальник ЭВМ;
Гришаева Татьяна Маврикиевна - техник.
Территориально кафедра размещалась в аудиториях радиотехнического корпуса.
Со дня основания на кафедре САПР успешно велась учебно-методическая работа. Были разработаны учебные планы по новым специализациям, подготовлено большое число новых учебных курсов и лабораторных работ. Организованы несколько учебных и научных лабораторий вычислительной техники, где установлены наиболее современные по тем временам ЭВМ, компьютерные и графические терминалы, модемы и другое оборудование.
Основным направлением научно-исследовательской работы являлись разработка и внедрение систем автоматизированного проектирования изделий радиоэлектронной техники. Еще с конца 70-х годов на кафедре КЭВА под руководством доцента Винтизенко И.Г. велись интенсивные работы по автоматизации проектирования печатных плат. Эти работы были продолжены на кафедре САПР. Разработано семейство учебно-проектных САПР двухсторонних печатных плат КАРЛ, которые успешно внедрялись на многих предприятиях и в высших учебных заведениях страны. САПР семейства КАРЛ использовались также в учебном процессе. По итогам этих работ в 1987-1988 гг. защищены две кандидатские диссертации Семисошенко В.Н. и Герасимом Г.А.
Также большое внимание на кафедре уделялось научно-исследовательской работе студентов. Наиболее способные и успевающие студенты работали в СКБ "Луч", выполняя реальные работы и внедряя их на предприятиях.
Разработка САПР печатных плат сопровождалась подготовкой квалифицированных инженерных кадров, а также коллектива преподавателей кафедры нового направления.
На кафедре САПР также проводились культурно-развлекательные мероприятия. Устраивались вечера специальности и КВН между студентами и сотрудниками, спортивные соревнования. Кафедра отличалась неформальным духом общения преподавателей и студентов.

Так как кафедра успешно развивалась, в ее коллектив вливались новые кадры: Бабак Ленид Иванович - доцент, к.т.н. (перешел с кафедры РУУ ТИАСУР в 1985 г.), Жульмин Владимир Иванович - доцент, к.т.н. (ТПИ в 1985 г.), Волынская Лариса Александровна - доцент, к.т.н. (ТПИ в 1990 г.), Венцель Тамара Владимировна - инженер-переводчик. После окончания института остались работать на кафедре ее выпускники: Метелев Павел Альбертович - инженер (выпускник каф. КУДР), Богомолов Андрей Иванович - ассистент, Чурсин Юрий Дмитриевич - инженер, Нейфельд Валерий Валерьевич - ассистент, Богатов Леонид Викторович - инженер, Тытарь Игорь Анатольевич - инженер, Батин Дмитрий Михайлович - инженер, Русских Сергей Андреевич - инженер, Загузина Наталья Павловна - инженер (выпускница ФСУ), Пилевина Марина Витальевна - ассистент, Пилевин Иван Александрович - инженер, Степанова Елена Васильевна - инженер, Соколова Елена Николаевна - ассистент (выпускница ТГУ), Малыхова Татьяна Александровна - техник, Яшкова Инна Анатольевна - инженер (выпускница ТГУ), и другие.
В связи с поступлением в докторантуру Винтизенко Игоря Георгиевича с 10 ноября 1987 года заведующим кафедрой САПР становится Жульмин Владимир Иванович.
В 1988 году Минвузом РСФСР на кафедре САПР разрешается открыть специальность 2203 - "Системы автоматизированного проектирования".
В феврале 1989 года в ТИАСУРе образуется новый факультет - вычислительных систем и кафедра САПР входит в его состав.
В 90-е годы начинается перестройка в стране. Она затрагивает и кафедру САПР. В 1991 году меняется профессорско-преподавательский состав кафедры. Из ТПИ приходят на кафедру новые преподаватели: Жигалова Елена Федоровна - доцент, к.т.н.; Карминская Татьяна Дмитриевна - доцент, к.т.н.; Губин Игорь Георгиевич - доцент, к.т.н., Горбань Татьяна Алексеевна - техник (перешла из деканата РКФ).
Меняется руководство кафедры, со 2 января 1992 года заведующим кафедрой САПР становится Шурыгин Юрий Алексеевич - доктор технических наук, профессор, член-корреспондент РИА. Жизнь течет и изменяется, совершенствуется вычислительная техника, меняются ГОСы и учебные планы, вводятся новые дисциплины. На кафедру устраиваются новые сотрудники - такие как Зюзьков Валентин Михайлович - доцент (НИИПММ, в 1992 году), Дьячко Анатолий Николаевич - зав. лабораторией (перешел с кафедры РУУ), Коваленко Ольга Альбертовна - инженер, вливаются новые выпускники - Потапова Евгения Андреевна - инженер, Черкашин Михаил Владимирович - ассистент, затем старший преподаватель (выпускник РТФ), Коротин Александр Владимирович - ассистент (выпускник ФСУ), Поляков Алексей Юрьевич - инженер, Соколов Алексей Геннадьевич - инженер и другие.
До 1992 года основными потребителями выпускников специальности 22.03.00 были предприятия радиотехнической и электронной промышленности, в основном Сибирского региона. С 1992 года структура потребления выпускников изменилась и изменилось распределение выпускников. Большая часть выпускников готовится (в том числе по индивидуальным контрактам) для предприятий нефте- и газодобывающего комплекса, предприятий сервисного обслуживания ЭВМ, частных фирм. Усилилась ориентация на региональные потребности (Сибирь, Урал, Якутия).

На кафедре развиваются следующие научные направления:

1. Разработка аппаратно-программных средств автоматизации технологических процессов с использованием устройств преобразовательной микропроцессорной техники, автоматизированного электропривода.
Разработка систем автоматизированного проектирования электротехнических устройств (систем электропитания, в том числе гарантированного, электропривода постоянного и переменного тока и т.д.).
Научный руководитель направлений - зав.каф.САПР, д.т.н., профессор, член-корреспондент Российской Инженерной Академии Ю.А.Шурыгин.
Свыше 70 систем гарантированного электропитания хирургических и реанимационных отделений больниц внедрено на территории Западной Сибири.
10 систем управления электрошпинделем внутришлифовальных станков внедрено на ГПЗ-5 и 2 - на Томском заводе режущих инструментов.
Свыше 20 систем автоматизированной подачи топлива в котлы внедрено на предприятиях теплоэнергетического комплекса Сибирского региона (Томская, Беловская, Шарыповская, Красноярская и др. ГРЭС).
Свыше 15 источников электропитания внедрено в Нижневартовске на электронной ГТС.
На 11 кустах Лугинецкого месторождения ОАО "Томскнефть" внедрены аппаратно-программные средства автоматизации технологических процессов добычи нефти.
Разработан пакет прикладных программ, обеспечивающий функционирование АРМ проектировщика сложных электромеханических систем.
В рамках указанных направлений подготовлены 1 доктор и 2 кандидата наук.

2. Разработка теории, методов, алгоритмов и программных средств проектирования сложных технических устройств и систем на основе декомпозиционного подхода.
Разработка теории, методов, алгоритмов и программных средств автоматизированного проектирования полупроводниковых СВЧ устройств.
Руководитель направлений - к.т.н., доц. Бабак Л.И.
Разработаны теория, методы и алгоритмы автоматизированного синтеза полупроводниковых СВЧ устройств. Разработаны программы и пакеты программ автоматизированного проектирования активных и пассивных ВЧ и СВЧ устройств. Разработаны теория и алгоритмы параметрического и декомпозиционного синтеза сложных технических устройств и систем на основе метода проекций. Разрабатывается универсальная программа для решения задач проектирования сложных технических устройств и систем различного назначения. В рамках этих разработок защищена кандидатская диссертация Поляковым Алексеем Юрьевичем.
В соответствии с решением Ученого Совета ТУСУРа об объединении кафедр "Систем автоматизированного проектирования" (САПР) и "Оптимальных и адаптивных систем управления" (ОАСУ) 8 декабря 1997 года создается кафедра "Компьютерные системы в управлении и проектировании" (КСУП) в структуре факультета вычислительных систем, заведующим кафедрой остается Шурыгин Ю.А.

Соответственно увеличивается коллектив кафедры, с кафедры ОАСУ переходят:
Бондаренко Владимир Петрович - профессор, д.т.н;
Тарасенко Владимир Петрович - профессор, д.т.н.;
Силич Виктор Алексеевич - доцент, профессор, д.т.н.;
Одиноков Владимир Викторович - доцент, к.т.н.;
Карпов Александр Георгиевич - доцент, к.т.н.;
Кручинин Владимир Викторович - доцент, к.т.н.;
Коцубинский Владислав Петрович - старший преподаватель;
Хабибулина Надежда Юрьевна - старший преподаватель;
Дорожкин Евгений Петрович - зав. лабораторией;
Столярова Людмила Владимировна - инженер-программист;
Коровина Вера Владимировна - техник;
Селезнева Лариса Константиновна - техник.
На кафедре увеличился профессорско-преподавательский состав, из НИИПММ пришел Шелупанов Александр Александрович - профессор, д.т.н.
По окончании кафедры ОАСУ остаются работать ее выпускники - Рыбалка Евгений Николаевич - ассистент, Борисов Сергей Иванович - ассистент.
На кафедре КСУП осуществляется подготовка студентов по двум специальностям - 210100 - управление и информатика в технических системах и 220300 - системы автоматизированного проектирования.
Набор студентов по специальности 220300 проводится в 2 учебные группы с плановой численностью 32 человека, а по специальности 210100 в одну группу численностью 16 человек. Кроме планового приема на специальности осуществляется и коммерческий прием. Динамика приема на специальности характеризуется как положительная. На кафедре КСУП также осуществляется и дистанционное образование. Ведется научно-исследовательская деятельность, поддерживается международное сотрудничество. Сотрудники кафедры поддерживают постоянные контакты с институтом электро- и радиоинженеров (IEEE), США, а также с представителями ведущих зарубежных фирм - разработчиков программного обеспечения для автоматизированного проектирования радиоэлектронной аппаратуры: Hewlett Packard EEsof, Inc (США), Compact Software (США), Optotek (Канада), Number One System (Великобритания) и др. Доцент Л.И.Бабак получил предложение о членстве в Нью-Иоркской академии наук.